最新动态更多>>

安隆科讯春节放假公告

各位给予安隆科讯支持的老师们:   您们好!我们安隆科讯的春节放假时间定为1月20日-2月2日,2月3号(正月初七正式上班)。节假日期间如果您有什么需要咨询或者帮助以及有推荐文章或者反馈意见的,依然可以通过邮箱sales@anachro.com,或者通过微信公众号(安隆代谢组)给我们留言,我们会尽快回复您的消息!   提前祝各位老师新年快乐,万事如意,大吉大利!

2016春季培训班圆满结束

4月16-17日  武汉

武汉安隆科讯开展了为期两天的代谢组培训班活动,期间共有11位老师分别对代谢组学实验方法及操作流程、NMR基础及数据处理、LC-MS基础及数据处理、GC-MS基础及数据处理、统计学数据解析、代谢组学实验策略及文章、如何选择合适的统计学方法及脂质组学研究进展等方面进行了介绍。为保证培训班的质量,这一期实行小班授课,且每节课程都设有互动环节,大家可以对有疑问的地方当堂提问。培训班现场气氛十分活跃,随着课程的进行每每出现整齐的翻动书页的声音,这认真的氛围让在场的小编都感到与有荣焉~

这期培训班没有报上名的老师也别担心,安隆科讯计划每年开展4期培训班活动,期待下一期培训班能够与您相遇,如果您对我们的培训班有什么好的建议和意见,欢迎将您的建议发送到sales@anachro.com这个邮箱,我们会定期送上答谢小礼品哦~

培训班咨询电话:027-87258771   
培训班咨询 QQ:800082094

安隆科讯春节放假公告

各位给予安隆科讯支持的老师们:   您们好,由于特殊安排,我们今年的放假时间会比往年早一点,春节放假时间定为1月29日-2月13日,我们将于2月14日(正月初七)开始正常上班。节假日期间如果您有什么需要咨询或帮助的,依然可以通过邮件sales@anachro.com,或者通过微信公众号(安隆代谢组)给我们留言,我们会尽快回复您的消息!   提前祝各位老师新年快乐!猴年大吉!

2016代谢组暨多元变量统计分析培训班(第一期)

2016代谢组暨多元变量统计分析培训班(第一期)

Training course of metabolomics & MVDA.2016(1st)

代谢组学( Metabolomics )是继基因组学和蛋白质组学之后发展起来的一门新兴学科,在疾病、药毒药理、植物、微生物、食品、营养等多个研究领域正扮演着越来越重要的角色。随着研究的不断深人,代谢组学在实验设计、分析平台、数据处理及整体流程上都面临了越来越多的挑战。 武汉安隆科讯技术有限公司代谢组培训班将邀请国内从事不同代谢组研究的专家学者们一起,围绕当今代谢组学的研究热点及前沿领域,为大家深度探讨如何将代谢组学技术与自己的研究领域完美结合、目前国际上的先进代谢组学分析技术与数据处理经验以及相关文章的撰写与发表等。

 培训时间:

2016年 4月16-17日

 培训地址:

 武汉马哥孛罗酒店(武汉市江岸区沿江大道159号时代广场)
日期 时间 课程名称 课程内容
4月16日 (周六) 08:30-09:00 开班仪式-欢迎致辞 授课老师及学员介绍
09:00-09:45 代谢组学简介及应用 1.  代谢组学简介   2.  代谢组学三大研究平台基本介绍     3.  代谢组学的应用领域
09:45-10:30 代谢组学实验方法及操作流程 1.  代谢组学一般实验流程   2.  代谢组学样本收集及注意事项
10:30-10:45 茶歇
10:45-12:00 NMR基础及数据处理专题 1.  NMR基本知识简介    2.  基于NMR的不同代谢组数据处理方法及比较 3.  NMR代谢组案例解析
12:00-13:00 午餐
13:00-13:30 1. 现场演示液氮模样2. 现场制作液氮冰淇淋,免费品尝
13:30-15:00 LC-MS基础及数据处理专题 1.  LC-MS基本知识简介   2.  LC-MS定性定量技术要点   3.  XCMS数据处理方法
15:00-15:15 茶歇
15:15-16:45 GC-MS基础及数据处理专题 1.  GC-MS基本知识简介    2.  GC-MS定性定量技术要点 3.  GC-MS数据处理方法    4.  LC-MS和GC-MS在广筛中的应用
15:15-17:00 答疑
17:30-19:00 欢迎晚宴
08:30-09:30 统计学数据解析 1.   预处理、归一化    2.  PCA、PLS-DA、OPLS-DA、ROC 3.  模型构建、验证     4.  差异物筛选     5. 聚类分析   6.  热图 7.  差异代谢通路分析
4月17日 (周日) 09:30-10:30 如何针对代谢组的数据特点 选择合适的统计学方法 1.  代谢组学的数据特点 2.  如何选择合适的统计学方法
10:30-10:45 茶歇
10:45-11:10 11:10-11:35 11:35-12:00 案例解析 代谢组学在医学领域的应用 代谢组学在动物营养研究中的应用 代谢组学在植物研究中的应用
12:00-13:00 午餐
13:00-13:30 趣味科学分享——搞笑诺贝尔奖
13:30-15:00 15:00-15:15 代谢组学实验策略及文章发表 1.   代谢组学实验设计,代谢组与既有研究方向如何结合,如何帮助我们 2.  文章发表中数据的利用及图表的选择    3.  代谢组数据发表杂志的方向 4.   专业代谢组方向杂志期刊的影响因子、实验数据要求及对代谢组实验 研究标准的倡议书
15:15-16:30 茶歇
16:30-17:00 脂质组学简介及应用 1.    脂质组学简介     2.  基于质谱的脂质组学研究方法    3.  脂质组学的应用
交流活动

 相关事项说明如下:

培 训 费:3500元/人(含学费、资料费、午餐及欢迎晚宴),住宿自理 报名事项:2016年3月15日前完成缴费,培训费9折优惠 报名截止日期:2016年4月15日(报满截止,不接受现场报名缴费) 报名人数:人数限制为35人 报名格式:发送您的姓名、单位、研究方法、联系方式和邮箱地址      至:zhiping.xu@anachro.com完成报名工作。      

 转账方式:

汇款到以下账户,不接受现金 开户名: 武汉安隆科讯技术有限公司    
开户行: 建行武汉省直支行 帐 号: 42001868608053029721    
税 号: 420105587996854  汇款时请务必注明学员姓名、单位和“安隆科讯培训班”字样;    汇款后请将汇款凭证电子版发送至    邮箱zhiping.xu@anachro.com,以确保汇款安全。

 联系方式:

联系地点:武汉市武昌区和平大道1178号,武汉安隆科讯技术有限公司 联系人:徐志平 
联系电话:17771863626 
     
027-87258771 
邮箱:
zhiping.xu@anachro.com

上海交大学术交流活动圆满结束!

6月29日  上海

我们来到了上海交通大学,虽然下着大雨,但还是有很多老师和同学冒雨前来参加活动,在此感谢各位老师和同学的支持。在上海交大分析测试中心我们与各位老师同学一起分享代谢组学近年来的发展与应用,并在实际案例中一起学习和了解其他研究者们如何设计代谢组实验,思考这些案例中有哪些值得我们借鉴的方面,有哪些可以改善的方面,会议最后还分享了代谢组学研究的一般流程和常见分析平台及样本制备方法,希望对各位老师今后的实验有所帮助,会议现场各位老师热烈讨论、积极提问,并提出了各自感兴趣的问题,此次上海交通大学的圆满成功离不开各位老师的支持,在此,再次表示感谢!我们也随时欢迎对代谢组研究感兴趣的各位老师致电垂询!

代谢组学的发展与应用 -上海交通大学正式版PPT 下载

生物技术

 微生物

 系统生物学

 细胞生物学

应用前景:
随着生物技术水平的不断发展,基因组、蛋白组等上游组学在微生物领域的研究逐渐成熟,如何延伸研究成果,突破研究瓶颈?如何更系统性描述生物体研究现象,使研究成果向具体实践转化?代谢组学的应用需求将逐渐增加。

沙门氏菌的多细胞发展改变全局代谢表型

研究背景

生物膜作为一种细菌的多细胞行为,被认为是在自然界最常见的存在形式,并与超过60%的致病菌有关,它能够很好地降低外界因素影响,提高微生物生存率的理论已经得到广泛认可,但是这些微生物如何在不同环境下形成类似性质生物膜的调控机制尚不明确。

研究目的

通过代谢组和转录分析生物膜相关的代谢调控网络及环境耐受能力。

实验设计

1. 样本分类:野生型鼠伤寒沙门氏菌,csgD缺失突变菌株
2. GC-MS和NMR进行代谢物检测

研究结果

通过代谢组学数据分析结果找到研究切入点,合理设计后续基因转录试验,以及结合多层面生物学信息进行微生物研究做出了一个很好的示范,在此只对文章中提到的代谢组学分析及糖异生路径的多组学分析结果进行描述。
1通过多元统计学分析找到25个显著差异代谢物。大部分在野生型中含量更高的差异代谢物包括葡萄糖及其形成的多聚体、糖原、半乳糖,甘露糖,和甘油-3-磷酸等都是糖异生的终产物;2在csgD缺失突变菌株中含量变高的代谢物有琥珀酸盐、富马酸盐、苹果酸盐、聚胺化合物腐胺、尸胺、腺苷一磷酸(AMP)、腺嘌呤和脯氨酸;3将这些显著差异代谢物放入代谢通路分析显示糖异生路径在野生型中被激活,或是在csgD缺失的菌株中受到了抑制;4在csgD缺失菌株中存在糖异生路径中受到阻碍,致使TCA循环中产物及多胺物质产生蓄积。这也从AMP在csgD缺失菌株内含量的升高得到了代谢水平上的数据支持;
5在基因表达水平上,共监控59个单基因或多基因的表达情况,涵盖了从代谢组学数据中了解的所有可能变化通路;6转录分析表明,在野生型细胞聚集的同时伴随着大量相关基因的激活,而在csgD缺失菌株中就没有观察到这种现象;7在监控包括琥珀酸脱氢酶(sdhCD),延胡索酸还原酶(fumAC)和苹果酸脱氢酶(MDH)在内的TCA上游通路相关基因表达时发现,野生型菌株在聚集的过程中这些基因都有明显上调,而在csgD缺失菌株内表达下降提示TCA循环中间产物的升高不是由于相关酶上调所造成的,而更可能是由于糖异生受到了抑制所造成的。
研究启示——多组学结合应用
代谢组学作为一种新型分析方法,能够帮助研究者们从代谢层面解释生物现象,并能够通过多组学交叉验证帮助验证上游组学结果,使研究结果更具有可信度,得到更丰富的生物学信息。
原文索引:
A Global Metabolic Shift is Linked to Salmonella Multicelluar Development, Plos One, 2010, 5(7):1-12

生物技术领域2015年发表的文献

  1. Bhute, V. J.; Palecek, S. P. Metabolic responses induced by DNA damage and poly (ADP-ribose) polymerase (PARP) inhibition in MCF-7 cells. Metabolomics 2015, 11, 1779-1791. (IF:3.855)
  2. Huang, Z.; Shao, W.; Gu, J.; Hu, X.; Shi, Y.; Xu, W.; Huang, C.; Lin, D. Effects of culture media on metabolic profiling of the human gastric cancer cell line SGC7901. Molecular bioSystems 2015, 11, 1832-1840. (IF:3.210)(chenomx)
  3. Paiva, C.; Amaral, A.; Rodriguez, M.; Canyellas, N.; Correig, X.; Ballesca, J. L.; Ramalho-Santos, J.; Oliva, R. Identification of endogenous metabolites in human sperm cells using proton nuclear magnetic resonance (1H-NMR) spectroscopy and gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS). Andrology 2015, 3, 496-505. (IF:2.596)
  4. Wang, B.; Sheriff, S.; Balasubramaniam, A.; Kennedy, M. A. NMR based metabolomics study of Y2 receptor activation by neuropeptide Y in the SK-N-BE2 human neuroblastoma cell line. Metabolomics 2015, 11, 1243-1252. (IF:3.855)
  5. Wen, H.; Cho, H. R.; Yun, T.; Kim, H.; Park, C. K.; Lee, S. H.; Choi, S. H.; Park, S. Metabolomic comparison between cells over-expressing isocitrate dehydrogenase 1 and 2 mutants and the effects of an inhibitor on the metabolism. Journal of neurochemistry 2015, 132, 183-193. (IF:4.281)
  6. Kalfe, A.; Telfah, A.; Lambert, J.; Hergenroder, R. Looking into Living Cell Systems: Planar Waveguide Microfluidic NMR Detector for in Vitro Metabolomics of Tumor Spheroids. Analytical chemistry 2015, 87, 7402-7410. (IF:5.636)
  7. Davies, S. K.; Bundy, J. G.; Leroi, A. M. Metabolic Youth in Middle Age: Predicting Aging in Caenorhabditis elegans Using Metabolomics. Journal of proteome research 2015, 14, 4603-4609. (IF:4.245)
  8. Herbst, F. A.; Danielsen, H. N.; Wimmer, R.; Nielsen, P. H.; Dueholm, M. S. Label-free quantification reveals major proteomic changes in Pseudomonas putida F1 during the exponential growth phase. Proteomics 2015, 15, 3244-3252. (IF:4.132)
  9. Kuhlisch C, Pohnert G. Metabolomics in chemical ecology[J]. Natural product reports, 2015.
  10. Lam C W, Law C Y, Sze K H, et al. Quantitative metabolomics of urine for rapid etiological diagnosis of urinary tract infection: Evaluation of a microbial–mammalian co-metabolite as a diagnostic biomarker[J]. Clinica Chimica Acta, 2015, 438: 24-28.
  11. Lamichhane S, Westerhuis J A, Ouwehand A C, et al. Gut microbial activity as influenced by fiber digestion: dynamic metabolomics in an in vitro colon simulator[J]. Metabolomics, 2016, 12(2): 1-12.
  12. Gibbons H, McNulty B A, Nugent A P, et al. A metabolomics approach to the identification of biomarkers of sugar-sweetened beverage intake[J]. The American journal of clinical nutrition, 2015, 101(3): 471-477.
  13. Zhang W, Tan N G J, Fu B, et al. Metallomics and NMR-based metabolomics of Chlorella sp. reveal the synergistic role of copper and cadmium in multi-metal toxicity and oxidative stress[J]. Metallomics, 2015, 7(3): 426-438.
  14. Jung J, Jung Y, Gill B, et al. Metabolic Responses to Orientia tsutsugamushi Infection in a Mouse Model[J]. PLoS neglected tropical diseases, 2015, 9(1): e3427.
  15. Villar M, Ayllón N, Alberdi P, et al. Integrated metabolomics, transcriptomics and proteomics identifies metabolic pathways affected by Anaplasma phagocytophilum infection in tick cells[J]. Molecular & Cellular Proteomics, 2015, 14(12): 3154-3172.